در این گلخانه ها معمولاً نهال ها را از بذر یا به صورت نهال می کارند و با استفاده از خاک یا بسترهای مخصوص محیط رشد سالم ایجاد می شود. عواملی مانند دما، رطوبت و نور در گلخانه به دقت کنترل می شوند. گلخانه های نهال به دقت طراحی شده اند تا نهال ها بتوانند سیستم ریشه ای قوی و تنه های سالم ایجاد کنند. این نوع گلخانه ها شرایط ایده آلی را در مرحله اولیه گیاهان فراهم می کنند و به تولید نهال های سالم کمک می کنند که بعداً به باغ ها یا مزارع منتقل می شوند.
